隨著基因科技的不斷發(fā)展,科學(xué)家運用先進的基因測序技術(shù)開展跨領(lǐng)域泛基因組研究,基因科技助力創(chuàng)新成果層出不窮。

近日,中央廣播電視總臺正式發(fā)布2022年度國內(nèi)、國際十大科技新聞,其中,由西南大學(xué)家蠶基因組生物學(xué)國家重點實驗室主任、國家蠶桑產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系首席科學(xué)家代方銀教授團隊聯(lián)合華大基因等單位合作完成的家蠶超級泛基因組項目入選2022年度國內(nèi)十大科技新聞。

研究團隊基于華大基因自主研發(fā)的時空組學(xué)技術(shù)Stereo-seq,對1078份蠶種質(zhì)資源進行了深度短讀長測序,并對其中545份代表性資源進行了長讀長測序,產(chǎn)生55.57T基因組數(shù)據(jù),組裝了545個蠶的高質(zhì)量基因組,對100個基因組進行了基因注釋,鑒定到4,300余萬個SNP、930余萬個Indel、340余萬個結(jié)構(gòu)變異(SV)和7,308個新基因(家族),繪制了一個世界首張千蠶高精度家蠶泛基因組圖譜,助力人類構(gòu)建泛基因組,賦能未來作物育種。

中國科學(xué)家繪制完成世界首張千蠶高精度基因遺傳變異圖譜

近年來,單細胞組學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展,使得研究團隊從單個細胞中獲得大量的轉(zhuǎn)錄組、表觀遺傳和蛋白質(zhì)組學(xué)信息。能夠幫助細胞的基因表達信息和空間信息一一對應(yīng)的空間組學(xué)技術(shù)則成為了2022年最值得關(guān)注的七大年度技術(shù)之一。

華大基因作為基因行業(yè)的奠基者,致力于通過基因檢測、質(zhì)譜檢測、生物信息分析等多組學(xué)大數(shù)據(jù)技術(shù)手段,為科研機構(gòu)、企事業(yè)單位、醫(yī)療機構(gòu)、社會衛(wèi)生組織等提供研究服務(wù)和精準醫(yī)學(xué)檢測綜合解決方案。2021年初,華大基因重磅發(fā)布其自主研發(fā)的時空組學(xué)技術(shù)Stereo-seq。該技術(shù)通過時空捕獲芯片,結(jié)合原位RNA捕獲,實現(xiàn)了500 nm的分辨率,同時捕獲面積可達13cm x 13cm,成為全球首個同時實現(xiàn)“納米級分辨率”和“厘米級全景視場”的技術(shù)。

被譽為新時代分子“顯微鏡”的Stereo-seq技術(shù),自發(fā)布以來,為人類重新認知器官結(jié)構(gòu)、生命發(fā)育、物種演化和定義人類疾病提供了底層工具,持續(xù)創(chuàng)造生命科學(xué)領(lǐng)域的多項突破性研究。在繪就世界首張千蠶高精度基因遺傳變異圖譜之前,該項技術(shù)助力繪就小鼠器官發(fā)生圖譜、斑馬魚胚胎發(fā)生過程中基因表達全景圖譜及發(fā)育軌跡的時空映射、果蠅胚胎和幼蟲發(fā)育的高分辨率3D時空轉(zhuǎn)錄組圖譜等多項泛基因組項目研究。

華大基因助力科研團隊繪就千蠶高精度基因遺傳變異圖譜之外,還率先完成家蠶基因庫數(shù)字化的構(gòu)建,對于深化功能基因組研究和推動家蠶模式化,開啟家蠶設(shè)計育種,賦能“改造家蠶、多元利用”等方向?qū)⑻峁┲匾目茖W(xué)支撐。未來,華大基因?qū)楦嗫蒲袌F隊提供時空組學(xué)等多專業(yè)基因測序技術(shù)與服務(wù),破解物種培育密碼,助力多領(lǐng)域物種育種。

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