消息:世界首個野生梨基因組圖譜組裝完成
論文第一作者、中國農(nóng)科院果樹研究所董星光博士介紹,該項研究以山西杜梨為材料,結合PacBio三代測序、Bionano光學圖譜、Hi-C技術,杜梨基因組組裝大小為532.7兆,contig N50為1.57兆,共有59552個蛋白質(zhì)編碼基因和247.4兆重復序列被注釋,通過BUSCO對基因組完整性進行評估,完整性達到95.9%。杜梨擴張基因在次生代謝通路中顯著富集,可能進而影響杜梨較強的逆境適應性。同源基因比對分析結果顯示,東方梨馴化過程中果實大小、糖代謝和轉(zhuǎn)運以及光合效率受到正向選擇。杜梨基因組中總共鑒定出573個NBS類型抗病基因,其中150個是TNL型抗病基因,在已發(fā)表的薔薇科基因組中數(shù)量最多,解釋了杜梨作為野生種的強抗病性。
他表示,梨屬植物在馴化過程中果實酸澀味逐漸消失。研究發(fā)現(xiàn),杜梨原花青素合成結構基因拷貝數(shù)顯著多于白梨,影響了原花青素的積累,同時花青素還原酶代謝途徑是原花青素合成的唯一途徑,山梨醇轉(zhuǎn)運蛋白跨膜轉(zhuǎn)運可能是影響可溶性有機物質(zhì)積累的主要因素。
責任編輯:孫知兵
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